Bir Yıl Savaşı'nın bitiminden yedi ay sonra, Zeon Diktatörlüğü'nden arta kalanlar Zeon Cumhuriyeti'ni kurar ve Federasyon'la mücadelelerine kaldıkları yerden devam ederler. Daryl Thunderbolt Sektörü'ndeki savaşta mobil süit Psycho Zaku'ya pilotluk etmiş ve Mua Kardeşliği Donanması'nın imhasında büyük bir rol oynamıştır. Psycho Zaku'yu yitirdikten sonra Dünya'ya iner ve Dünya Federasyonu'na bağlı askerî bir grup olan Güney Denizleri İttifakı hakkında istihbarat toplamaya başlar. Io ise prototip mobil süit Atlas Gundam'a pilotluk etmekle görevlendirilmiştir.